許多旅客規劃關西行程時，常將奈良視為陸地名勝，卻忽略了這座古都周邊其實藏著豐富的水上體驗選擇。事實上，與奈良縣相鄰的滋賀縣境內擁有日本最大的淡水湖泊——琵琶湖，湖面面積達670平方公里，相當於 大阪的四分之一。從奈良市區出發，搭乘JR或近鐵電車約40分鐘即可抵達琵琶湖畔的大津站或堅田站，展開完全不同的水域之旅。
琵琶湖的渡輪服務與一般沿海航線性質不同，主要提供湖上觀光與交通功能。琵琶湖汽船株式會社經營的多條航線中，最具特色的是「琵琶湖大橋線」，連線湖南岸的大津與北岸的今津、竹生島，單程票價約¥1,500-2,500。這條航線不僅是當地居民的日常通勤工具，更是觀光客體驗琵琶湖風光的最佳方式。船艙設有開放式甲板，春秋季節涼風徐徐，夏季則可感受湖面涼意，比市區低約3-5度，是消暑的好選擇。
如果時間有限，推薦選擇「竹生島周遊船」。竹生島位於琵琶湖北部，是一座面積僅約1公里的火山島，島上的寶嚴寺供奉弁才天女神，是日本三大弁才天之一。從唐崎港出發的周遊船行程含登島參拜，票價約¥3,500，航程約25分鐘。這座島嶼的神秘之處在於其地質結構——島上隨處可見六角形的柱狀玄武岩，這是200萬年前火山活動形成的自然景觀，與奈良東吉野村的火山地形有異曲同工之妙。
另一個值得推薦的是「琵琶湖疏洪道船遊」。這是配合琵琶湖治理工程而開發的觀光航線，從近江大橋下的碼頭出發，沿途可見湖中小島與遠方山巒。導覽員會以日文講解疏洪道的治水原理，對關心水利工程的旅客而言是難得的學習機會。票價¥2,000，含簡單茶點。這條航線的特色在於平靜的湖面與豐富的水鳥生態，運氣好時能看到鷺鷥與野鴨群棲的景象。
除了琵琶湖，從奈良前往神戶港同樣便捷。奈良站搭乘JR新快速至神戶站約70分鐘，票價¥1,200左右。神戶港的渡輪服務相對知名，這裡提供前往淡路的「神戶港渡輪」，單程¥1,800，航程約60分鐘。神戶港的優勢在於其機能導向——旅客可將藝術之旅與交通結合，從神戶港直接前往直島、豐島等藝術聖地，適合安排瀨戶內海藝術祭期間的行程。
對於想體驗更寧靜水域的旅客，奈良縣南部的吉野川同樣提供划船體驗。吉野川是日本三大急流之一，與渡輪性質不同，但近年來有業者引進橡皮艇體驗服務。從奈良市中心搭乘近鐵至吉野站約50分鐘，橡皮艇半日體驗費用約¥5,000-8,000，含裝備與教練指導。這項活動的亮點在於春天的櫻花河畔景色——吉野川沿岸種植超過3,000株櫻花樹，數量僅次於東京的上野公園，花期比東京晚約一週，是追逐櫻花的絕佳選擇。
實用資訊方面，琵琶湖汽船的營業時間為上午9點至下午5點，冬季（12月至2月）部分航線會減班或停駛，建議出發前一週至官網確認。竹生島登島參觀受限於潮汐時間，建議預留3小時以上的停留時間。神戶港渡輪的班次較多，但假日及藝術祭期間建議提前預約。
最後提醒，琵琶湖秋季的晨霧相當有名，攝影愛好者建議清晨6點前抵達碼頭。夏季午後常有區域性陣雨，但來得快去得也快，隨身攜帶折疊傘即可。整體而言，奈良周邊的水上體驗適合想跳脫傳統寺廟巡禮、探索不同面向關西的旅客，尤其是對自然景觀或水利工程感興趣的訪客。
